Im Jahr 1881 erbauten die Brüder Robert William und John Gourlay Harvey in einer perfekten Lage am Rande von Loch Indaal, am Ostufer von the Rhinns, dem westlichsten Ausläufer der Insel Islay, die Bruichladdich Destillerie. Damals zählte die Brennerei zu den modernsten Destillerien überhaupt. Große Teile der Start-Ausrüstung sind heute noch in Benutzung. Anders als die meisten Brennereien, die aus umgebauten Bauernhäusern entstanden sind, wurde Bruichladdich von Anfang an als Destillerie geplant und gebaut. Die Gebäude wurden rings um einen zentralen Hof angelegt. Dort befanden sich die Darren und eine Dampfmaschine zur Stromerzeugung.

In der Zeit von 1929 bis 1937 stand die Destillerie still. Danach folgten einige Besitzerwechsel. 1974 baute der damalige Besitzer Invergordon ein weiteres Paar Brennblasen ein. Im Jahr 1994 wurde die Brennerei erneut stillgelegt, bis sie am 19. Dezember 2000 von Mark Reynier und seinen beiden „Murray McDavid“-Kollegen Simon Coughlin und Gordon Wright für 7.500.000 £ gekauft und anschließend vollständig renoviert wurde. Als Brennmeister konnte Jim McEwan, der vorher bei Bowmore tätig gewesen war) gewonnen werden. Die viktorianische Ausstattung wurde größtenteils erhalten. Ein Team von Ingenieuren zerlegte damals viele Geräte, Brennöfen und Rohrleitungen, um sie zu reinigen, zu reparieren und anschließend wieder neu zusammen zu bauen.

Im März 2007 gab Mark Reynier offiziell bekannt, die bereits 1929 geschlossene Lochindaal-Brennerei wieder zu eröffnen, die auch unter dem Namen Port-Charlotte bekannt ist, den Örtchen, wo sie sich befand.

Am 23. Juli 2012 wurde bekanntgegeben, dass Rémy Cointreau die Brennerei Bruichladdich für 58.000.000 £ gekauft hat.